Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms