Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NICN1Q9BSH3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms