RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588672.1

LDLRAD4-AS1-201, LDLRAD4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4-AS1, Length 2,190 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.61■■■□□ 2.33
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCC9O60706 1549 aa23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.81■■□□□ 1.4
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SCRIBQ14160 1630 aa23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NACADO15069 1562 aa23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.11■■□□□ 1.29
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 WIZO95785 1651 aa22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SMARCA4P51532 1647 aa22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRIM41Q8WV44 630 aa22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SMARCA2P51531 1590 aa22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.27■■□□□ 1.15
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCC8Q09428 1581 aa22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NCAPD3P42695 1498 aa21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SOGA1O94964 1423 aa21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HMGXB3Q12766 1538 aa21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SYNJ1O43426 1573 aa21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HRCP23327 699 aa21.67■■□□□ 1.06
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EEA1Q15075 1411 aa21.66■■□□□ 1.06
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.65■■□□□ 1.06
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TOP2BQ02880 1626 aa21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CFTRP13569 1480 aa21.53■■□□□ 1.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.52■■□□□ 1.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEP162Q5TB80 1403 aa21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GOLGA3Q08378 1498 aa21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CUX1P39880 1505 aa21.44■■□□□ 1.02
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIF21BO75037 1637 aa21.4■■□□□ 1.02
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PRDM2Q13029 1718 aa21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.32■■□□□ 1
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LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CLIP1P30622 1438 aa21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PRXQ9BXM0 1461 aa21.2■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIF27Q86VH2 1401 aa21.19■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NESP48681 1621 aa21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.14■□□□□ 0.98
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.12■□□□□ 0.97
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LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CUX2O14529 1486 aa21.09■□□□□ 0.97
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.06■□□□□ 0.96
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGF1RP08069 1367 aa21.02■□□□□ 0.96
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21■□□□□ 0.95
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TOPBP1Q92547 1522 aa20.98■□□□□ 0.95
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.98■□□□□ 0.95
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.96■□□□□ 0.95
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ARAP1Q96P48 1450 aa20.95■□□□□ 0.94
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.91■□□□□ 0.94
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 APLP2Q06481 763 aa20.87■□□□□ 0.93
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.87■□□□□ 0.93
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.84■□□□□ 0.93
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.84■□□□□ 0.93
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.8■□□□□ 0.92
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 WDR97A6NE52 1622 aa20.74■□□□□ 0.91
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CUL7Q14999 1698 aa20.68■□□□□ 0.9
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.67■□□□□ 0.9
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.63■□□□□ 0.89
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 P3H3Q8IVL6 736 aa20.63■□□□□ 0.89
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