Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CAMK2BQ13554 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CAMK2BQ13554 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 AC027313.1-201ENST00000509159 1666 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CAMK2BQ13554 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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