Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SERP1Q9Y6X1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SERP1Q9Y6X1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms