Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL25A1Q9BXS0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms