Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIOK2Q9BVS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIOK2Q9BVS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms