Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM87AQ8NBN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms