Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms