Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms