Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms