Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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CRY1Q16526 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY1Q16526 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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