Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1BP51168 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1BP51168 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms