Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2P22307 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCP2P22307 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCP2P22307 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCP2P22307 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCP2P22307 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2P22307 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2P22307 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms