Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms