Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR1P11362 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR1P11362 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms