Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE40O14503 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms