Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SEPT7-219ENST00000635476 506 ntTSL 523.37■■□□□ 1.337e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.957e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.117e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-215ENST00000635047 760 ntTSL 47.4□□□□□ -1.227e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-211ENST00000493626 643 ntTSL 45.98□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 25.7□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-208ENST00000475109 733 ntTSL 55.11□□□□□ -1.597e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 44.62□□□□□ -1.677e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 24.42□□□□□ -1.77e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.896e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.696e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DGCR6L-203ENST00000443409 935 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 POP5-204ENST00000535245 608 ntTSL 311.09□□□□□ -0.631e-26■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 POP5-208ENST00000542776 821 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-26■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.334e-9■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.174e-9■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PDE9A-214ENST00000460905 715 ntTSL 523.51■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 419.95■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-222ENST00000487112 792 ntTSL 319.81■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LRIG3-203ENST00000433272 3693 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DDR1-231ENST00000417521 1479 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-221ENST00000485602 832 ntTSL 516.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-220ENST00000483829 813 ntTSL 216.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-223ENST00000489571 879 ntTSL 216■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-236ENST00000532535 560 ntTSL 416■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-218ENST00000478773 917 ntTSL 316■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-237ENST00000534498 463 ntTSL 415.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-211ENST00000464590 846 ntTSL 315.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-226ENST00000495026 788 ntTSL 514.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-233ENST00000529944 539 ntTSL 414.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-213ENST00000465237 962 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DDR1-275ENST00000514434 514 ntTSL 313.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-230ENST00000527810 567 ntTSL 313.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-229ENST00000525937 654 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-234ENST00000532017 1513 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-215ENST00000469307 798 ntTSL 312.53□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LMO7-204ENST00000377499 3472 ntTSL 212.46□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-213ENST00000521777 2430 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 42.7
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DDX3XO00571 PGAP2-225ENST00000493547 1772 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-231ENST00000528216 1815 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-216ENST00000475884 745 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-217ENST00000477358 1474 ntTSL 510.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-217ENST00000523303 2578 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-228ENST00000524661 483 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DDR1-242ENST00000465966 268 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LMO7-224ENST00000533305 720 ntTSL 58.87□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-215ENST00000522363 2045 ntTSL 28.79□□□□□ -13e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 DDR1-273ENST00000513514 186 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-203ENST00000518510 756 ntTSL 58.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-210ENST00000520983 1154 ntTSL 26.45□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-208ENST00000520437 416 ntTSL 36.26□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-219ENST00000524081 668 ntTSL 36.26□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-206ENST00000520184 559 ntTSL 45.4□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 INTS9-218ENST00000523436 929 ntTSL 35.37□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.398e-10■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 AMHR2-206ENST00000552233 2162 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 AMHR2-205ENST00000550839 887 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 AMHR2-203ENST00000548303 583 ntTSL 313.09□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 BAIAP2-AS1-201ENST00000573167 4014 ntTSL 219.3■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 ADAM15-231ENST00000533732 544 ntTSL 518.57■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 ADAM15-230ENST00000531831 552 ntTSL 216.63■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 ADAM15-219ENST00000477533 348 ntTSL 416.54■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 ADAM15-229ENST00000531703 492 ntTSL 415.62■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 42.6
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