RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487112.5

PGAP2-222, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-222	ENST00000487112	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.64	■■■■■ 4.26
PGAP2-222	ENST00000487112	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.33	■■■■□ 3.41
PGAP2-222	ENST00000487112	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.03	■■■■□ 3.2
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCC9	O60706	1549 aa		34.68	■■■■□ 3.14
PGAP2-222	ENST00000487112	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.55	■■■■□ 3.12
PGAP2-222	ENST00000487112	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PGAP2-222	ENST00000487112	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PGAP2-222	ENST00000487112	NACAD	O15069	1562 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PGAP2-222	ENST00000487112	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.81	■■■■□ 3
PGAP2-222	ENST00000487112	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PGAP2-222	ENST00000487112	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PGAP2-222	ENST00000487112	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PGAP2-222	ENST00000487112	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PGAP2-222	ENST00000487112	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PGAP2-222	ENST00000487112	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PGAP2-222	ENST00000487112	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PGAP2-222	ENST00000487112	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PGAP2-222	ENST00000487112	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.22	■■■□□ 2.75
PGAP2-222	ENST00000487112	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PGAP2-222	ENST00000487112	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PGAP2-222	ENST00000487112	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PGAP2-222	ENST00000487112	WIZ	O95785	1651 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PGAP2-222	ENST00000487112	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PGAP2-222	ENST00000487112	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PGAP2-222	ENST00000487112	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PGAP2-222	ENST00000487112	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PGAP2-222	ENST00000487112	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PGAP2-222	ENST00000487112	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PGAP2-222	ENST00000487112	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PGAP2-222	ENST00000487112	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PGAP2-222	ENST00000487112	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PGAP2-222	ENST00000487112	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PGAP2-222	ENST00000487112	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PGAP2-222	ENST00000487112	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.74	■■■□□ 2.51
PGAP2-222	ENST00000487112	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.69	■■■□□ 2.5
PGAP2-222	ENST00000487112	CFTR	P13569	1480 aa		30.53	■■■□□ 2.48
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.49	■■■□□ 2.47
PGAP2-222	ENST00000487112	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.42	■■■□□ 2.46	9e-6	■■■■■ 50.1
PGAP2-222	ENST00000487112	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.41	■■■□□ 2.46
PGAP2-222	ENST00000487112	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PGAP2-222	ENST00000487112	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PGAP2-222	ENST00000487112	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PGAP2-222	ENST00000487112	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PGAP2-222	ENST00000487112	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PGAP2-222	ENST00000487112	EEA1	Q15075	1411 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PGAP2-222	ENST00000487112	CUX2	O14529	1486 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PGAP2-222	ENST00000487112	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PGAP2-222	ENST00000487112	CUX1	P39880	1505 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PGAP2-222	ENST00000487112	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
PGAP2-222	ENST00000487112	NES	P48681	1621 aa		30	■■■□□ 2.39
PGAP2-222	ENST00000487112	SOGA1	O94964	1423 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PGAP2-222	ENST00000487112	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PGAP2-222	ENST00000487112	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PGAP2-222	ENST00000487112	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PGAP2-222	ENST00000487112	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PGAP2-222	ENST00000487112	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PGAP2-222	ENST00000487112	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PGAP2-222	ENST00000487112	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PGAP2-222	ENST00000487112	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PGAP2-222	ENST00000487112	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PGAP2-222	ENST00000487112	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PGAP2-222	ENST00000487112	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
PGAP2-222	ENST00000487112	KIF21B	O75037	1637 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PGAP2-222	ENST00000487112	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PGAP2-222	ENST00000487112	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PGAP2-222	ENST00000487112	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
PGAP2-222	ENST00000487112	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PGAP2-222	ENST00000487112	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.52	■■■□□ 2.32
PGAP2-222	ENST00000487112	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
PGAP2-222	ENST00000487112	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PGAP2-222	ENST00000487112	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PGAP2-222	ENST00000487112	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PGAP2-222	ENST00000487112	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PGAP2-222	ENST00000487112	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PGAP2-222	ENST00000487112	WDR62	O43379	1518 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PGAP2-222	ENST00000487112	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PGAP2-222	ENST00000487112	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PGAP2-222	ENST00000487112	IGF1R	P08069	1367 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PGAP2-222	ENST00000487112	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PGAP2-222	ENST00000487112	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PGAP2-222	ENST00000487112	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PGAP2-222	ENST00000487112	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PGAP2-222	ENST00000487112	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PGAP2-222	ENST00000487112	CUL7	Q14999	1698 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PGAP2-222	ENST00000487112	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PGAP2-222	ENST00000487112	CLIP1	P30622	1438 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PGAP2-222	ENST00000487112	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PGAP2-222	ENST00000487112	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
PGAP2-222	ENST00000487112	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PGAP2-222	ENST00000487112	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PGAP2-222	ENST00000487112	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PGAP2-222	ENST00000487112	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PGAP2-222	ENST00000487112	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PGAP2-222	ENST00000487112	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PGAP2-222	ENST00000487112	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PGAP2-222	ENST00000487112	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PGAP2-222	ENST00000487112	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PGAP2-222	ENST00000487112	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19

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