RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.28	■■■■□ 3.88
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.2	■■■■□ 3.23
PGAP2-223	ENST00000489571	ABCC9	O60706	1549 aa		34.85	■■■■□ 3.17
PGAP2-223	ENST00000489571	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PGAP2-223	ENST00000489571	NACAD	O15069	1562 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PGAP2-223	ENST00000489571	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PGAP2-223	ENST00000489571	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PGAP2-223	ENST00000489571	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PGAP2-223	ENST00000489571	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PGAP2-223	ENST00000489571	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PGAP2-223	ENST00000489571	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.45	■■■□□ 2.79
PGAP2-223	ENST00000489571	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PGAP2-223	ENST00000489571	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PGAP2-223	ENST00000489571	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PGAP2-223	ENST00000489571	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PGAP2-223	ENST00000489571	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PGAP2-223	ENST00000489571	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
PGAP2-223	ENST00000489571	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PGAP2-223	ENST00000489571	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.62	■■■□□ 2.49
PGAP2-223	ENST00000489571	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PGAP2-223	ENST00000489571	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.54	■■■□□ 2.48
PGAP2-223	ENST00000489571	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.49	■■■□□ 2.47
PGAP2-223	ENST00000489571	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.49	■■■□□ 2.47
PGAP2-223	ENST00000489571	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.42	■■■□□ 2.46
PGAP2-223	ENST00000489571	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PGAP2-223	ENST00000489571	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PGAP2-223	ENST00000489571	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.26	■■■□□ 2.44
PGAP2-223	ENST00000489571	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PGAP2-223	ENST00000489571	NES	P48681	1621 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PGAP2-223	ENST00000489571	WIZ	O95785	1651 aa		29.95	■■■□□ 2.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CUX2	O14529	1486 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PGAP2-223	ENST00000489571	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PGAP2-223	ENST00000489571	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PGAP2-223	ENST00000489571	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PGAP2-223	ENST00000489571	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PGAP2-223	ENST00000489571	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
PGAP2-223	ENST00000489571	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PGAP2-223	ENST00000489571	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PGAP2-223	ENST00000489571	CFTR	P13569	1480 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PGAP2-223	ENST00000489571	WDR62	O43379	1518 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PGAP2-223	ENST00000489571	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PGAP2-223	ENST00000489571	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PGAP2-223	ENST00000489571	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PGAP2-223	ENST00000489571	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PGAP2-223	ENST00000489571	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PGAP2-223	ENST00000489571	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PGAP2-223	ENST00000489571	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PGAP2-223	ENST00000489571	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PGAP2-223	ENST00000489571	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PGAP2-223	ENST00000489571	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PGAP2-223	ENST00000489571	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
PGAP2-223	ENST00000489571	CUX1	P39880	1505 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PGAP2-223	ENST00000489571	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.43	■■■□□ 2.14
PGAP2-223	ENST00000489571	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PGAP2-223	ENST00000489571	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PGAP2-223	ENST00000489571	SOGA1	O94964	1423 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PGAP2-223	ENST00000489571	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PGAP2-223	ENST00000489571	CHD1	O14646	1710 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PGAP2-223	ENST00000489571	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PGAP2-223	ENST00000489571	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PGAP2-223	ENST00000489571	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PGAP2-223	ENST00000489571	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PGAP2-223	ENST00000489571	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PGAP2-223	ENST00000489571	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PGAP2-223	ENST00000489571	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PGAP2-223	ENST00000489571	FBLN2	P98095	1184 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PGAP2-223	ENST00000489571	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.14	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PGAP2-223	ENST00000489571	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PGAP2-223	ENST00000489571	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.04	■■■□□ 2.08	9e-6	■■■■■ 50.1
PGAP2-223	ENST00000489571	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PGAP2-223	ENST00000489571	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PGAP2-223	ENST00000489571	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PGAP2-223	ENST00000489571	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PGAP2-223	ENST00000489571	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PGAP2-223	ENST00000489571	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PGAP2-223	ENST00000489571	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PGAP2-223	ENST00000489571	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PGAP2-223	ENST00000489571	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PGAP2-223	ENST00000489571	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PGAP2-223	ENST00000489571	NUP160	Q12769	1436 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PGAP2-223	ENST00000489571	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.56	■■■□□ 2
PGAP2-223	ENST00000489571	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.56	■■■□□ 2
PGAP2-223	ENST00000489571	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PGAP2-223	ENST00000489571	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PGAP2-223	ENST00000489571	CUL7	Q14999	1698 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PGAP2-223	ENST00000489571	IGF1R	P08069	1367 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PGAP2-223	ENST00000489571	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.43	■■□□□ 1.98

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