Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R2

MMP24, Matrix metalloproteinase-24, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP24Q9Y5R2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP24Q9Y5R2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP24Q9Y5R2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP24Q9Y5R2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP24Q9Y5R2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP24Q9Y5R2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP24Q9Y5R2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP24Q9Y5R2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP24Q9Y5R2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP24Q9Y5R2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP24Q9Y5R2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms