Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms