Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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