Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP18Q9UMW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP18Q9UMW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP18Q9UMW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP18Q9UMW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP18Q9UMW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP18Q9UMW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP18Q9UMW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP18Q9UMW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP18Q9UMW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP18Q9UMW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms