Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NRXN1Q9ULB1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NRXN1Q9ULB1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
NRXN1Q9ULB1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
NRXN1Q9ULB1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NRXN1Q9ULB1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.05■■■■■ 4
NRXN1Q9ULB1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NRXN1Q9ULB1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NRXN1Q9ULB1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NRXN1Q9ULB1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NRXN1Q9ULB1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NRXN1Q9ULB1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NRXN1Q9ULB1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NRXN1Q9ULB1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NRXN1Q9ULB1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
NRXN1Q9ULB1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NRXN1Q9ULB1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NRXN1Q9ULB1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NRXN1Q9ULB1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NRXN1Q9ULB1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
NRXN1Q9ULB1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NRXN1Q9ULB1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NRXN1Q9ULB1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NRXN1Q9ULB1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NRXN1Q9ULB1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
NRXN1Q9ULB1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NRXN1Q9ULB1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NRXN1Q9ULB1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NRXN1Q9ULB1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NRXN1Q9ULB1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NRXN1Q9ULB1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NRXN1Q9ULB1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NRXN1Q9ULB1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NRXN1Q9ULB1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NRXN1Q9ULB1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NRXN1Q9ULB1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
NRXN1Q9ULB1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NRXN1Q9ULB1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NRXN1Q9ULB1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NRXN1Q9ULB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NRXN1Q9ULB1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
NRXN1Q9ULB1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NRXN1Q9ULB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NRXN1Q9ULB1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms