Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF2Q9UK05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF2Q9UK05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF2Q9UK05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF2Q9UK05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF2Q9UK05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF2Q9UK05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF2Q9UK05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF2Q9UK05 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms