Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD3Q9UJU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD3Q9UJU5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD3Q9UJU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD3Q9UJU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD3Q9UJU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD3Q9UJU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD3Q9UJU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD3Q9UJU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD3Q9UJU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD3Q9UJU5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms