Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRM2Q9UI43 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRM2Q9UI43 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRM2Q9UI43 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRM2Q9UI43 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRM2Q9UI43 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRM2Q9UI43 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRM2Q9UI43 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRM2Q9UI43 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRM2Q9UI43 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRM2Q9UI43 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRM2Q9UI43 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRM2Q9UI43 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms