Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3BQ9UH17 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
APOBEC3BQ9UH17 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3BQ9UH17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC3BQ9UH17 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOBEC3BQ9UH17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3BQ9UH17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3BQ9UH17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3BQ9UH17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3BQ9UH17 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3BQ9UH17 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3BQ9UH17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3BQ9UH17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3BQ9UH17 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3BQ9UH17 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3BQ9UH17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3BQ9UH17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3BQ9UH17 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms