Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN3Q9UGI6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNN3Q9UGI6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN3Q9UGI6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNN3Q9UGI6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN3Q9UGI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNN3Q9UGI6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNN3Q9UGI6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN3Q9UGI6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN3Q9UGI6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms