Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DKK2Q9UBU2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DKK2Q9UBU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DKK2Q9UBU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DKK2Q9UBU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK2Q9UBU2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK2Q9UBU2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK2Q9UBU2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK2Q9UBU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DKK2Q9UBU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK2Q9UBU2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK2Q9UBU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK2Q9UBU2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms