Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
SLAIN2Q9P270 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SLAIN2Q9P270 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SLAIN2Q9P270 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
SLAIN2Q9P270 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SLAIN2Q9P270 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SLAIN2Q9P270 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SLAIN2Q9P270 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SLAIN2Q9P270 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SLAIN2Q9P270 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SLAIN2Q9P270 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SLAIN2Q9P270 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SLAIN2Q9P270 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SLAIN2Q9P270 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SLAIN2Q9P270 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SLAIN2Q9P270 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SLAIN2Q9P270 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SLAIN2Q9P270 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SLAIN2Q9P270 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SLAIN2Q9P270 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SLAIN2Q9P270 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SLAIN2Q9P270 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SLAIN2Q9P270 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SLAIN2Q9P270 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SLAIN2Q9P270 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SLAIN2Q9P270 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SLAIN2Q9P270 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SLAIN2Q9P270 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SLAIN2Q9P270 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SLAIN2Q9P270 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SLAIN2Q9P270 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SLAIN2Q9P270 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SLAIN2Q9P270 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SLAIN2Q9P270 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SLAIN2Q9P270 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SLAIN2Q9P270 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SLAIN2Q9P270 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SLAIN2Q9P270 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SLAIN2Q9P270 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SLAIN2Q9P270 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SLAIN2Q9P270 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SLAIN2Q9P270 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SLAIN2Q9P270 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms