Protein–RNA interactions for Protein: Q9P227

ARHGAP23, Rho GTPase-activating protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP23Q9P227 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGAP23Q9P227 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGAP23Q9P227 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARHGAP23Q9P227 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARHGAP23Q9P227 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARHGAP23Q9P227 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGAP23Q9P227 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP23Q9P227 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP23Q9P227 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP23Q9P227 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
ARHGAP23Q9P227 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP23Q9P227 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGAP23Q9P227 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGAP23Q9P227 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGAP23Q9P227 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGAP23Q9P227 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ARHGAP23Q9P227 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGAP23Q9P227 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP23Q9P227 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP23Q9P227 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGAP23Q9P227 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGAP23Q9P227 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARHGAP23Q9P227 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP23Q9P227 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP23Q9P227 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARHGAP23Q9P227 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ARHGAP23Q9P227 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ARHGAP23Q9P227 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.51■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGAP23Q9P227 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGAP23Q9P227 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
ARHGAP23Q9P227 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGAP23Q9P227 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGAP23Q9P227 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGAP23Q9P227 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
ARHGAP23Q9P227 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ARHGAP23Q9P227 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGAP23Q9P227 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ARHGAP23Q9P227 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGAP23Q9P227 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ARHGAP23Q9P227 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGAP23Q9P227 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ARHGAP23Q9P227 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ARHGAP23Q9P227 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARHGAP23Q9P227 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARHGAP23Q9P227 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARHGAP23Q9P227 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms