Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HMG20BQ9P0W2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMG20BQ9P0W2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMG20BQ9P0W2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMG20BQ9P0W2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HMG20BQ9P0W2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HMG20BQ9P0W2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HMG20BQ9P0W2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HMG20BQ9P0W2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HMG20BQ9P0W2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HMG20BQ9P0W2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HMG20BQ9P0W2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMG20BQ9P0W2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMG20BQ9P0W2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMG20BQ9P0W2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HMG20BQ9P0W2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HMG20BQ9P0W2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HMG20BQ9P0W2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HMG20BQ9P0W2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
HMG20BQ9P0W2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms