Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMC3Q9P0I2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMC3Q9P0I2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EMC3Q9P0I2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMC3Q9P0I2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMC3Q9P0I2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMC3Q9P0I2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EMC3Q9P0I2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC3Q9P0I2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMC3Q9P0I2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMC3Q9P0I2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMC3Q9P0I2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms