Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGA3Q9NZ52 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GGA3Q9NZ52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GGA3Q9NZ52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms