Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SLC52A1Q9NWF4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SLC52A1Q9NWF4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SLC52A1Q9NWF4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SLC52A1Q9NWF4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SLC52A1Q9NWF4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SLC52A1Q9NWF4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SLC52A1Q9NWF4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SLC52A1Q9NWF4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SLC52A1Q9NWF4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SLC52A1Q9NWF4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SLC52A1Q9NWF4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SLC52A1Q9NWF4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SLC52A1Q9NWF4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SLC52A1Q9NWF4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SLC52A1Q9NWF4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SLC52A1Q9NWF4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SLC52A1Q9NWF4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SLC52A1Q9NWF4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SLC52A1Q9NWF4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
SLC52A1Q9NWF4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SLC52A1Q9NWF4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
SLC52A1Q9NWF4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SLC52A1Q9NWF4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SLC52A1Q9NWF4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SLC52A1Q9NWF4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SLC52A1Q9NWF4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SLC52A1Q9NWF4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SLC52A1Q9NWF4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SLC52A1Q9NWF4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SLC52A1Q9NWF4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SLC52A1Q9NWF4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SLC52A1Q9NWF4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SLC52A1Q9NWF4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SLC52A1Q9NWF4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SLC52A1Q9NWF4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SLC52A1Q9NWF4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SLC52A1Q9NWF4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SLC52A1Q9NWF4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SLC52A1Q9NWF4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SLC52A1Q9NWF4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SLC52A1Q9NWF4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms