Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf12Q9NSK7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf12Q9NSK7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf12Q9NSK7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf12Q9NSK7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf12Q9NSK7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf12Q9NSK7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf12Q9NSK7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf12Q9NSK7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf12Q9NSK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf12Q9NSK7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf12Q9NSK7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms