Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ARHGAP35Q9NRY4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ARHGAP35Q9NRY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
ARHGAP35Q9NRY4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ARHGAP35Q9NRY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ARHGAP35Q9NRY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARHGAP35Q9NRY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
ARHGAP35Q9NRY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARHGAP35Q9NRY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ARHGAP35Q9NRY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ARHGAP35Q9NRY4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARHGAP35Q9NRY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARHGAP35Q9NRY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ARHGAP35Q9NRY4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARHGAP35Q9NRY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
ARHGAP35Q9NRY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ARHGAP35Q9NRY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ARHGAP35Q9NRY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ARHGAP35Q9NRY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARHGAP35Q9NRY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ARHGAP35Q9NRY4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ARHGAP35Q9NRY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ARHGAP35Q9NRY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ARHGAP35Q9NRY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARHGAP35Q9NRY4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ARHGAP35Q9NRY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
ARHGAP35Q9NRY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
ARHGAP35Q9NRY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ARHGAP35Q9NRY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ARHGAP35Q9NRY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ARHGAP35Q9NRY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ARHGAP35Q9NRY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARHGAP35Q9NRY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARHGAP35Q9NRY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ARHGAP35Q9NRY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
ARHGAP35Q9NRY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ARHGAP35Q9NRY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ARHGAP35Q9NRY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ARHGAP35Q9NRY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ARHGAP35Q9NRY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ARHGAP35Q9NRY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ARHGAP35Q9NRY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARHGAP35Q9NRY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ARHGAP35Q9NRY4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ARHGAP35Q9NRY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARHGAP35Q9NRY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ARHGAP35Q9NRY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ARHGAP35Q9NRY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
ARHGAP35Q9NRY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ARHGAP35Q9NRY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms