Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERINC1Q9NRX5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERINC1Q9NRX5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERINC1Q9NRX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERINC1Q9NRX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERINC1Q9NRX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERINC1Q9NRX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERINC1Q9NRX5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERINC1Q9NRX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERINC1Q9NRX5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERINC1Q9NRX5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERINC1Q9NRX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERINC1Q9NRX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERINC1Q9NRX5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERINC1Q9NRX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERINC1Q9NRX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms