Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHRAC1Q9NRG0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRAC1Q9NRG0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRAC1Q9NRG0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRAC1Q9NRG0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRAC1Q9NRG0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRAC1Q9NRG0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRAC1Q9NRG0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRAC1Q9NRG0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRAC1Q9NRG0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRAC1Q9NRG0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRAC1Q9NRG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRAC1Q9NRG0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRAC1Q9NRG0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRAC1Q9NRG0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRAC1Q9NRG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms