Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SARS2Q9NP81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SARS2Q9NP81 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SARS2Q9NP81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARS2Q9NP81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARS2Q9NP81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SARS2Q9NP81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARS2Q9NP81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SARS2Q9NP81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SARS2Q9NP81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms