Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH0

RHOF, Rho-related GTP-binding protein RhoF, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOFQ9HBH0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOFQ9HBH0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOFQ9HBH0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOFQ9HBH0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOFQ9HBH0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOFQ9HBH0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOFQ9HBH0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOFQ9HBH0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOFQ9HBH0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOFQ9HBH0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms