Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPK1Q9H3S4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPK1Q9H3S4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPK1Q9H3S4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPK1Q9H3S4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TPK1Q9H3S4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPK1Q9H3S4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPK1Q9H3S4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPK1Q9H3S4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPK1Q9H3S4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPK1Q9H3S4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPK1Q9H3S4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms