Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A7

POLR2J3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3Q9H1A7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2J3Q9H1A7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2J3Q9H1A7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2J3Q9H1A7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2J3Q9H1A7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2J3Q9H1A7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2J3Q9H1A7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2J3Q9H1A7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2J3Q9H1A7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2J3Q9H1A7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2J3Q9H1A7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2J3Q9H1A7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms