Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHCBP1LQ9BZQ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHCBP1LQ9BZQ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHCBP1LQ9BZQ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHCBP1LQ9BZQ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHCBP1LQ9BZQ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHCBP1LQ9BZQ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHCBP1LQ9BZQ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SHCBP1LQ9BZQ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms