Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSX2Q9BZM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSX2Q9BZM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSX2Q9BZM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSX2Q9BZM3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSX2Q9BZM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSX2Q9BZM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSX2Q9BZM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GSX2Q9BZM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms