Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRIP1Q9BX63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BRIP1Q9BX63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
BRIP1Q9BX63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRIP1Q9BX63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRIP1Q9BX63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRIP1Q9BX63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRIP1Q9BX63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRIP1Q9BX63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRIP1Q9BX63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
BRIP1Q9BX63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRIP1Q9BX63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRIP1Q9BX63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRIP1Q9BX63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BRIP1Q9BX63 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BRIP1Q9BX63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRIP1Q9BX63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BRIP1Q9BX63 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BRIP1Q9BX63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BRIP1Q9BX63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BRIP1Q9BX63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
BRIP1Q9BX63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BRIP1Q9BX63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BRIP1Q9BX63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms