Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPAP1Q9BWH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPAP1Q9BWH6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPAP1Q9BWH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RPAP1Q9BWH6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPAP1Q9BWH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPAP1Q9BWH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP1Q9BWH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPAP1Q9BWH6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPAP1Q9BWH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPAP1Q9BWH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RPAP1Q9BWH6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RPAP1Q9BWH6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPAP1Q9BWH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RPAP1Q9BWH6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPAP1Q9BWH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPAP1Q9BWH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPAP1Q9BWH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPAP1Q9BWH6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPAP1Q9BWH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPAP1Q9BWH6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPAP1Q9BWH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPAP1Q9BWH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms