Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC11Q9BVV2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC11Q9BVV2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC11Q9BVV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC11Q9BVV2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC11Q9BVV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC11Q9BVV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC11Q9BVV2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC11Q9BVV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC11Q9BVV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC11Q9BVV2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC11Q9BVV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC11Q9BVV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC11Q9BVV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC11Q9BVV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms