Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KATNB1Q9BVA0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KATNB1Q9BVA0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNB1Q9BVA0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNB1Q9BVA0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KATNB1Q9BVA0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KATNB1Q9BVA0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KATNB1Q9BVA0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KATNB1Q9BVA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KATNB1Q9BVA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNB1Q9BVA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KATNB1Q9BVA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KATNB1Q9BVA0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KATNB1Q9BVA0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KATNB1Q9BVA0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms